Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms