Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms