Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCG2Q9UNQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms