Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCDHA12Q9UN75 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCDHA12Q9UN75 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms