Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPCN1Q9ULQ1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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