Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PADI1Q9ULC6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms