Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms