Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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