Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms