Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNAL1Q9UBT7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms