Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXTL2Q9UBQ6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms