Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms