Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms