Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ASF1BQ9NVP2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ASF1BQ9NVP2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms