Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms