Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOMER3Q9NSC5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms