Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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