Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms