Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASS4Q9NQ75 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms