Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms