Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms