Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms