Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSER1Q9C0I3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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