Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMES1Q9C002 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms