Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms