Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms