Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms