Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF2Q99496 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF2Q99496 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF2Q99496 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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