Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC5LQ99459 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms