Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms