Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms