Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms