Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms