Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDC3Q96F86 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms