Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms