Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C12orf43Q96C57 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C12orf43Q96C57 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms