Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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