Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms