Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRUQ92729 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRUQ92729 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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