Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AP3S1Q92572 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3S1Q92572 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms