Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms