Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF12Q8WXF0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF12Q8WXF0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms