Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms