Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms