Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE22Q8NFJ8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms