Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms