Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AVL9Q8NBF6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms