Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms