Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL6Q8N841 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL6Q8N841 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms