Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms